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    翼和SNP分型技術(二):Hi-SNP技術

    發(fā)布時間: 2025-11-05  點擊次數(shù): 318次

    選擇SNP分型服務,可根據(jù)實驗規(guī)模決定。PCR-LDR技術適用于中低通量檢測,能精準滿足小規(guī)模實驗需求;基于二代測序的Hi-SNP技術則適合高通量檢測,為大規(guī)模實驗提供高效方案。

    1. Hi-SNP分型服務技術路線:

    圖片1.png

     

    2. 分型流程

    a. 位點評估:確認物種,版本,基因或序列信息,對SNP位點的同源性,(高同源不適合該方法檢測SNP,本公司有針對該狀況的特色服務),GC含量(含量過高可能導致檢測失?。┑冗M行評估,確定可行性。

    b. 樣本質控:電泳及濃度綜合質控,不合格的樣本反饋給客戶。單管操作,樣本消耗量少,100ng樣本就能做幾十上百個SNP。

    c. 引物設計合成:根據(jù)擴增子設計并合成引物。

    d. 擴增階段:調整各對引物的體積及反應條件,使得每對引物的擴增效率相當,同時擴增多個目標DNA片段。

    e. 樣本建庫:根據(jù)擴增產物進行建庫,加測序接頭,用不同barcode來區(qū)分,為測序做準備。

    f. 測序及數(shù)據(jù)分析:在illumina novaseq pe150 平臺上,對擴增子進行高通量測序,然后對測序結果進行分析,出率不足的(95%以上)要補數(shù)據(jù)。完成實驗報告。

     

    3. 翼和特色

    ● 自主知識產權的多重PCR為基礎,技術先進,結果準確

    ● 通量高,SNP位點30-500個之間,數(shù)百數(shù)千樣本推薦使用

    ● 平均測序深度1000倍,每個SNP位點測序深度至少幾百倍

    ● 適用性廣,適用于任何多態(tài)性位點

    ● 對SNP位點以及周圍序列進行測序,更準確,更靈敏

    ● 測序質量Q30>90%

    ● 檢出率95%以上

    ● 準確率>98%